1900年(清光绪26年，庚子年)7月17-21日，沙俄侵略者在黑龙江左岸，先后制造了震惊世界的海兰泡（今黑河市对岸布拉戈维申斯克）惨案，当时约有6000人被俄兵手持刀斧砍杀和推入江中溺水而亡；江东六十四屯惨案，经过沙俄血洗后约有7000余人被杀的惨案。因1900年是庚子年，中国人民习惯地称这一惨案为“庚子俄难”。海兰泡，位于黑龙江左岸、精奇里江右岸两江汇合处，原是中国的一个村庄。黑龙江和精奇里江汇流处岸边，结雅-布列亚平原西南端，黑龙江省黑河市区对岸。建有阿穆尔州最大的港口，河运事业发达。原属中国，本名“海兰泡”，1858年《中俄瑷珲条约》签订后被帝俄割占改今名。
江东六十四屯：江东六十四屯位于精奇里江口南至霍尔莫勒津屯，黑龙江左沿岸地带，“南北一百五十里许，东西八十里许”。这里的村庄是由清政府在清剿雅克萨沙俄侵略者时设立的军屯点发展起来的，通称江左旗屯。人们又习惯于以屯数命名，记载中出现过“二十八屯”、“三十余屯”、“四十三屯”、“四十八屯”等名称。惨案发生前，这里有六十四个村庄，又地处瑷珲江东，故称瑷珲江东六十四屯。清朝与沙俄签订了不平等条约，黑龙江北岸划归俄国。但由于江东六十四屯居住大量中国清朝居民，因此在划界时特别将此地归属于清朝管理。《中俄瑷珲条约》规定，中国人在江东六十四屯享有居住权，清政府对该处人民享有管辖权，但是清朝并无此地之主权。1900年发生义和团运动，清政府无暇兼顾东北情势，俄国遂派兵制造了江东六十四屯惨案和海兰泡惨案。一九〇二年中俄议和后，虽经清朝政府多次交涉，但沙俄政府却采取种种无赖手段，拒绝原住这个地区的中国人民返回世代久居的家园。
1858年5月28日，清朝黑龙江将军奕山与俄罗斯帝国东西伯利亚总督穆拉维约夫签订了《瑷珲条约》，条约将黑龙江以北、外兴安岭以南即外东北60多万平方公里领土划归俄国，仅在江东六十四屯地区保留了中国居民的永久居留权和清政府对居民的管辖权，在1860年11月14日签订的《中俄北京条约》又重申了这一规定，但《瑷珲条约》未对江东六十四屯地区的界限做出明确的规定，从而为日后的争端埋下了隐患。沙俄不断向远东地区移民，加速推行俄罗斯化以及对中国满蒙地区的野心。而江东六十四屯土地肥沃、盛产粮食的优势，自然成为了沙俄移民廉价的给养供应地。沙俄不断蚕食江东六十四屯，至1891年，江东六十四屯以北靠近精奇里江的土地，均被占去；南至霍尔默津屯的一带地方，则被俄人杂居。1900年，义和团运动在东北地区爆发，到7月达到高潮。在短短几十天内，义和团共拆毁铁路550俄里，破坏了几乎所有的电话线路，毁坏车头45个、平车1600节,烧毁桥梁4500俄丈和其他铁路设施,致使东清铁路工程全部停工。沙俄以保护铁路名义为由，阿穆尔总督尼古拉·戈罗戴科夫率1000名哥萨克携带大量武器辎重坐轮船进入中国防区，黑龙江将军寿山不允许通行，双方发生交战。交战时间持续三个小时。
随后，沙俄阿穆尔军区司令格里布斯基下令封锁黑龙江，扣留所有渡船，驱散渡口的中国难民。与此同时，警察局以“在中国人的住宅中发现了武器和炸药”为由，开始大肆搜捕中国人。1900年7月17日，俄军以“送中国人过江”的名义，徒步二十多里，将中国人驱赶至上布拉戈维申斯克的黑龙江边，沿途行动不便的老幼妇孺遭到杀害。到达江岸时，中国人发现根本没有一条渡江用的船和木筏。俄军从三面将中国人层层包围，用鞭打、刀刺、斧砍、枪击等方法，将中国人驱赶到江中淹死。先跳入江中的人很快被溺毙；不敢下水和反抗的人遭到射杀和砍杀，或是被俄军三、两个将辫子拴在一起，然后推进江里，连怀抱中的婴儿也不能幸免；气息未绝的伤者，被俄军用枪托打死后扔进江里或是直接抓住衣襟踢进江里；少数在江中泅渡的中国人，遭到俄军的射杀。浮尸飘满江面，岸边到处是受害者的鞋、帽子、手提包和其他零碎东西。随江波漂流至对岸的幸存者80余人，赤身露体，皆昏迷不能说话。从17日至21日，俄方共进行了四次屠杀，共有5000名中国人遭到杀害。22日，阿穆尔当局宣布：海兰泡市内的中国人已经全部被肃清了。在海兰泡大屠杀进行的同时，沙俄另派出军队在江东六十四屯展开扫荡。格里布斯基亲率骑兵，焚烧补丁屯，凿沉渡船，将未能逃离的二十八屯居民集中于一间大屋中，纵火焚烧，大部分人被活活烧死。俄军四处纵火，烧毁房屋，枪杀居民，仅在博尔多屯一地就杀害了上千人。最后又将未来得及过江的居民全部驱赶至江中淹死，侥幸生还者仅60至70人，江东六十四屯大屠杀又有2000名中国人遇难。2000名中国人遇难。同年7月21日，江东六十四屯被俄军全部占领。此外，在伊尔库茨克、尼布楚、伯力、海参崴、斯特烈田斯克、双城子、库页岛及黑龙江以北、乌苏里江以东其他地区，沙俄对当地的中国居民也展开了同样的大屠杀，遇害的中国居民数量不下20万。
关于庚子俄难中遇难的中国人数量，史料记载不一。其中海兰泡惨案的遇难人数，俄国方面，马洛泽莫夫的记载为3000人；基尔赫涅尔的记载为3000至3500人；弗里奇的记载为3000至4000人；维列沙金的记载为3000或1万人。英国方面，伦森的记载为不超过4000人；雨拉的记载为4800人；列奥·多伊奇的记载为1万至15000人。中国方面，寿山的记载为5000多人；吉林将军长顺的记载为5000至6000人。一般认为为5000人。江东六十四屯遇难者的人数，周树模的记载为5000人，一般认为为2000人。海兰泡和江东六十四屯惨案共造成7000名中国居民死亡。
